Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRAMP1Q96RY5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms