Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC38A2Q96QD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC38A2Q96QD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms