Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALS2CR12Q96Q35 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALS2CR12Q96Q35 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms