Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3Q96PU9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms