Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC3BQ96NL0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms