Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRELID3AQ96N28 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms