Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YTHDC1Q96MU7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms