Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGD4Q96M96 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD4Q96M96 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms