Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00477Q96M19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms