Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCZQ96LD1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms