Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZA3Q96KX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZA3Q96KX2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZA3Q96KX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms