Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM87BQ96K49 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87BQ96K49 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms