Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDLIM2Q96JY6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDLIM2Q96JY6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms