Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGBD1Q96JS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGBD1Q96JS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms