Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VCPIP1Q96JH7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms