Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COG3Q96JB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms