Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CELF6Q96J87 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms