Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCMH1Q96GD3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms