Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC97Q96F63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms