Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTNQ96CV9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OPTNQ96CV9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms