Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX21Q969T3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX21Q969T3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms