Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNRQ92752 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TNRQ92752 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNRQ92752 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TNRQ92752 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TNRQ92752 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRQ92752 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRQ92752 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TNRQ92752 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms