Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN4Q92575 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBXN4Q92575 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms