Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113Q902F9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113Q902F9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms