Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CSRNP3Q8WYN3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CSRNP3Q8WYN3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CSRNP3Q8WYN3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms