Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF31Q8WWY3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF31Q8WWY3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms