Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COL22A1Q8NFW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL22A1Q8NFW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL22A1Q8NFW1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms