Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC112Q8NEF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC112Q8NEF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms