Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BHLHE23Q8NDY6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms