Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC150Q8NCX0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC150Q8NCX0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms