Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIML1Q8N9V2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms