Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NECAB1Q8N987 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECAB1Q8N987 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms