Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC155Q8N6L0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC155Q8N6L0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms