Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC71Q8N4P6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC71Q8N4P6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms