Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHTF2Q8N3S3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHTF2Q8N3S3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms