Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC117Q8IWD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC117Q8IWD4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms