Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FMNL3Q8IVF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FMNL3Q8IVF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms