Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC3FQ8IUX4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC3FQ8IUX4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms