Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX29P2Q8IUI4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms