Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NME9Q86XW9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NME9Q86XW9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NME9Q86XW9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms