Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS37DQ86XT2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37DQ86XT2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms