Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RBBP6Q7Z6E9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms