Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9AQ7Z3C6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9AQ7Z3C6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG9AQ7Z3C6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG9AQ7Z3C6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms