Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTOP1Q7RTM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms