Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYFIP1Q7L576 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYFIP1Q7L576 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms