Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSH2Q76I76 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SSH2Q76I76 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSH2Q76I76 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms