Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMIM5Q71RC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMIM5Q71RC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms