Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms