Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC2Q6ZN30 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNC2Q6ZN30 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms