Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNE3Q6ZMZ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNE3Q6ZMZ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms